MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC2

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007487	G	6	6	15	20	0 %	0 %	100 %	0 %	77404589
2	NC_007487	CGA	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
3	NC_007487	CGA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
4	NC_007487	CGC	2	6	201	206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404589
5	NC_007487	GC	3	6	210	215	0 %	0 %	50 %	50 %	77404589
6	NC_007487	CA	3	6	278	283	50 %	0 %	0 %	50 %	77404589
7	NC_007487	TGG	2	6	289	294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404589
8	NC_007487	CGG	2	6	387	392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404589
9	NC_007487	CGGCC	2	10	456	465	0 %	0 %	40 %	60 %	77404589
10	NC_007487	CCA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404589
11	NC_007487	CA	3	6	499	504	50 %	0 %	0 %	50 %	77404589
12	NC_007487	TGGGCC	2	12	539	550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	77404589
13	NC_007487	GTG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77404589
14	NC_007487	ACC	2	6	635	640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77404589
15	NC_007487	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
16	NC_007487	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404589
17	NC_007487	GGC	2	6	796	801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404589
18	NC_007487	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77404589
19	NC_007487	ACG	2	6	854	859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404589
20	NC_007487	GCA	4	12	927	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404590
21	NC_007487	TCG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77404590
22	NC_007487	ACG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404590
23	NC_007487	CCGG	2	8	1196	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	77404591
24	NC_007487	CCGG	2	8	1219	1226	0 %	0 %	50 %	50 %	77404591
25	NC_007487	CCG	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404591
26	NC_007487	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77404591
27	NC_007487	GCC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77404591
28	NC_007487	GGC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77404591
29	NC_007487	CGGG	2	8	1460	1467	0 %	0 %	75 %	25 %	77404591
30	NC_007487	AGC	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77404591

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.